Berkat Carl, Grove Street Families kembali dikenal,dan Sweet memaafkan CJ. Ketika Sweet sedang mempersiapkan perang gang dengan rival abadinya, Ballas, CJ mendapat telpon dari Cesar, pacar saudara perempuannya Kendl, yang menunjukkannya sebuah Green Sabre dan mengungkapkan padanya bahwa Big Smoke dan Ryder beserta dengan Tenpenny terlibat dalam kematian ibu CJ dan rencana Sweet akan gagal karena Sweet dijebak. Carl mencoba memperingatkan Sweet melalui telpon tetapi ia gagal, dan dalam keputus asaan CJ berusaha menyelamatkannya.CJ dapat bertahan cukup lama melawan Ballas sebelum SWAT dan C.R.A.S.H. tiba, pada adegan penahanan Sweet dan Tenpenny membawa Carl jauh ke tempat antah berantah – sebuah desa kecil, Angel Pine, terisolasi antara Los Santos dan San Fierro. Sementara itu, dengan bantuan Ryder dan Big Smoke, Ballas mengambil alih wilayah Los Santos, membanjirinya dengan kokain.
Carl, sadar bahwa Tenpenny adalah satu-satunya harapannya agar tidak dipenjara atau membuat Sweet dibebaskan, kemudian ia melakukan pekerjaan kotor polisi korup, dan mulai membunuh orang-orang yang bisa menjerumuskan Tenpenny ke penjara. Pada saat itu, Carl menjalin pertemanan aliansi, diantaranya pemimpin Triad Cina yang buta dan pengusaha bernama Wu Zi Mu (yang sering dipanggil Woozie oleh CJ), dan seorang hippie tua bernama The Truth. Pada akhirnya Carl dan teman-temannya membuka sebuah garasi di San Fierro seraya menunggu peluang untuk kembali ke Los Santos.
Di San Fierro, Carl menginfiltrasi Loco Syndicate, yang menyuplai Ballas dengan narkobanya, CJ melakukan pekerjaan dengan anggota utama: Jizzy, kepala gang, T-Bone, the gang's muscle, dan agen pemerintah yang menyamar bernama Mike Toreno, administrator gang. Pada akhirnya Carl membunuh mereka semua, termasuk Ryder. Carl juga melakukan pekerjaan untuk Woozie yaitu membantu Triadnya menyingkirkan masalah dengan gang Vietnam, Da Nang Boys.
Carl kemudian terlibat dalam pekerjaan Toreno, yang selamat dari pertempuran dengan CJ, dan menyatakan bahwa ia akan membebaskan Sweet jika Carl membantunya dalam operasi rahasianya. Setelah berlatih menjadi seorang pilot, CJ kemudian melakukan operasi untuk Toreno. Lalu, Carl diundang oleh Woozie untuk menjadi rekan dalam kasino Triad di Las Venturas, dimana mereka menghadapi pelecehan dari Mafia pengelola kasino Caligula Palace. Akhirnya, Carl mendapat kesempatan untuk memasuki Kasino Caligula setelah The Truth memintanya untuk menyelamatkan Kent Paul dan Maccer, dimana The Truth kehilangan mereka saat perjalanan ke gurun. Kent Paul memperkenalkan Carl pada Manajer Kasino – seorang mantan pengacara bernama Ken Rosenberg, yang sedang dalam depresi karena permusuhan Mafia. Ia mengklaim bahwa jika satu keluarga mafia dihancurkan oleh keluarga lain, ia akan pasti dibunuh. Carl kemudian membantunya menyelamatkan Johnny Sindacco dari tangan Forellis. Tetapi, saat Carl dan Ken mengunjungi Sindaccos mereka harus menghapus seluruh keluarga Sindacco karena Johny mengenali Carl. Pada waktu yang singkat Ken menelpon CJ bahwa Leones menguasai kasino. Kemudian Carl melakukan pekerjaan untuk Salvatore Leone, Don Mafia, untuk memperoleh kepercayaannya sementara merencanakan penyerangan pada kasino Caligula bersama Woozie. Pada saat ini, Carl hidup lebih lama kegunaaannya untuk Tenpenny, yang mencoba, dan gagal, untuk membuat CJ terbunuh. Pada akhirnya, Carl dan Triad sukses merampok Caligula.
Toreno kemudian melakukan janjinya untuk membebaskan Sweet, tetapi Carl terkejut, karena Sweet tidak mau menjadi bagian dari gaya hidup CJ yang baru. Sweet memaksa untuk kembali ke Grove Street dan berusaha untuk mendirikan kembali GSF daripada menikmati kesuksesan Carl. Tenpenny kemudian diadili atas beberapa kejahatan, tetapi dakwaan tersebut dihentikan karena kurangnya bukti, hal ini berkat Carls yang membunuh para saksi atas kejahatan Tenpenny. Pembebasan Tenpenny menyebabkan penduduk kota Los Santos marah dan terjadi kerusuhan di seluruh kota, mirip seperti Kerusuhan Los Angeles 1992. Dikarenakan ketetapan hati Sweet untuk menghancurkan Big Smoke, yang menjadi Bandar narkoba terbesar di kota, Carl harus mengambil alih kembali teritori yang hilang dan memburu para pengkhianat yang bertanggung jawab atas narkoba yang menghancurkan GSF. CJ kemudian membunuh Big Smoke dalam tembak-menembak, kemudian kabur dari istana narkoba yang terbakar dan mengejar Tenpenny, yang kabur dengan uang Smoke.
Sweet dan Carl mengejar melewati jalanan Los Santos sampai Tenpenny kehilangan kendali atas truk pemadam kebakarannya dan akhirnya jatuh dari jembatan. Carl saat itu akan menembah Tenpenny, tetapi swwet menghentikannya, karena hal itu akan mengurangi kecurigaan polisi, jika Tenpenny mati karena luka parah atas kecelakaannya. Tenpenny kemudian mati, dan Keluarga Johnson bersatu kembali. Bersama teman dan aliansinya untuk merayakan kesuksesannya, Carl meninggalkan mereka. Ketika CJ ditanya kemana ia akan pergi ia menjawab, "Fittin' to hit the block, see what's happening” (pergi ke blok, untuk melihat apa yang terjadi.
Gangs : Grove street families , Ballas , Los santos vagos , Varrios loz aztecas , San fierro rifa , Da nang boys , Triaden.
Karakter : Carl Johnson "CJ" , Sean Johnson "Sweet" , Melvin Harris "Big smoke" , Lance Wilson "Ryder" , Kendl Johnson , Mark Wayne "B-Dub" , Jeffery Martin "Og log" , Cesar Vialpando , Wu zi mu "Woozie" , Frank Tenpenny , Eddie Pulaski
Senjata : Brass knuckles , baseball bat , nightstick , pool cue , golf club , shovel , knife , katana , chainsaw , 9mm , silenced 9mm , desert eagle , Tec-9 , micro smg , smg , shotgun , sawnoff shotgun , combat shotgun , M4 , AK 47 , rifle , sniper rifle , molotov cocktail , grenade , tear gas , remote explosives , flame thrower , vulcan mini gun , rocket lancher , heat seeking rocket launcher
yang lain : Spraycan , camera , fire extinguisher , parachute , thermal goggles , night vision goggles , jetpack , remote detonator , cane , flower , dildo 1 , dildo 2 , vibrator 1 , vibrator 2 , cellphone , skateboard.
Tempat makan : Cluckin bell , well stacked pizza , burger shot.
Kota : Los santos , badland , san fierro , las venturas
